L’entrée actuelle du monastère est composée par un ensemble de structures de l’époque médiévale et moderne, adaptées aux usages actuels. Des structures défensives médiévales y subsistent mais la plus grande partie de l’édifice fut bâtie entre les XVII^e et XVIII^e siècles pour en faire des entrepôts et des celliers.

Devant l’église se trouvent des dépendances identifiées comme des celliers, bâties entre les XVII^e et XVIII^e siècles, en même temps que les entrepôts du bloc d’entrée situés au-dessus. L’espace est divisé en différentes salles, couvertes avec le système de la fausse-voûte, et utilise la roche de la montagne comme élément constructif.

Au XI^e siècle, les travaux de l’église étant alors achevés, fut bâtie la galilée, un portique pour accueillir les fidèles et les pèlerins. Malgré l’aspect qu’elle présente actuellement à cause des spoliations que subit le monastère, c’était un espace monumental aux murs peints d’après ce que suggèrent les fragments de peinture conservés.

Au XII^e siècle, l’atelier du maître de Cabestany fut chargé de la décoration sculpturale du portail de l’église. Il s’agit de l’un des premiers portails monumentaux catalans, avec celui de la cathédrale de Vic et celle de Ripoll.

Sa situation à l’entrée du temple fait de la galilée un espace d’enterrement privilégié qui accueille des tombeaux de familles nobles rattachées au monastère. Avant la construction de l’église romane, cette zone était employée comme nécropole et des restes de tombes anthropomorphes creusées dans la roche ont été retrouvés.

Précédant la galilée, un grand arc est construit au XVII^e siècle, au-dessus duquel ressort une console représentant un buste humain aux cheveux longs.

L’église de Sant Pere de Rodes est l’élément le plus remarquable de l’ensemble par l’originalité de certains de ses éléments architecturaux.

Les dernières recherches suggèrent que les travaux auraient commencé à la fin du X^e siècle sur les restes d’une petite église et auraient pris fin à la deuxième moitié du XI^e, quand les nefs furent terminées et les sculptures incorporées.

Il s’agit d’un édifice à plan en croix latine à trois absides, bâti avec des pierres de différentes dimensions, pas très grandes, disposées en rangées plus ou moins régulières et en épi à certains endroits. En revanche, de grandes pierres de taille bien découpées sont employées pour les angles, les pilastres et les piliers.

La nef centrale se caractérise par son ampleur, tandis que les deux latérales, vu leur étroitesse, sont des lieux de passage qui mènent au déambulatoire à deux niveaux qui entoure l’abside centrale.

L’église est le centre d’une vie communautaire dédiée à l’oraison. La règle bénédictine structure la vie des moines en fonction des prières qui sont réparties tout le long de la journée. Le jour commence par le chant des laudes, à l’aube, et se poursuit par celui de prime, tierce, sexte, none, vêpres et complies, le soir. Le repos nocturne est interrompu par les matines chantées entre minuit et le lever du soleil, selon l’époque de l’année.

Outre ces prières communautaires, les moines pratiquent également la lectio divina, la lecture et la méditation individuelle.

La règle structure aussi les heures de travail manuel, considéré comme une partie essentielle de la vie monastique. C’est pourquoi saint Benoît prévoit une distribution des oraisons et du travail en l’adaptant aux conditions de chaque période de l’année. Suivant l’idéal de gagner leur pain, le type de travail auquel les moines se consacrent varie au fil du temps et des communautés, allant du travail agricole ou artisanal au service fourni aux pèlerins ou la copie manuscrite, comme c’est le cas à Sant Pere de Rodes.

Au début du XI^e siècle, les bâtiments qui formaient le monastère étaient agencés à partir de la construction d’un cloître.

Ce cloître est un élément exceptionnel car très peu sont encore conservés de cette époque. Il se caractérise par les arcs en plein cintre, légèrement outrepassés. À l’origine, les galeries étaient couvertes de poutres et les murs profusément décorés, comme le suggèrent les restes de peinture.

Il s’agit d’un modèle constructif propre à la fin du X^e siècle et du XI^e, qui nous est parvenu parce qu’il fut enterré pour bâtir par-dessus le cloître du XII^e siècle. Seules deux galeries restèrent en usage et le cloître resta caché jusqu’à sa découverte lors des travaux de restauration du début des années quatre-vingt-dix. Grâce à cela, il conserva son aspect original tandis que le reste de l’ensemble était adapté aux nouveaux goûts ou besoins.

Les travaux de restauration ont mis au jour un ancien accès au monastère situé à côté de l’église. Un portail en travertin donnait sur un passage creusé dans la roche qui pénétrait vers l’église. Lors de la construction de la galilée, un autre portail à arc en plein cintre fut adossé sur celui-ci. Néanmoins, cette entrée fut condamnée au XII^e siècle quand la cour d’entrée fut rénovée et la porte actuelle fut créée, centrée dans la façade. 

Dans tous les monastères, le cloître est le point à partir duquel les autres dépendances sont agencées, en suivant une distribution répondant aux besoins quotidiens. Si le temps a pu modifier la fonction des bâtiments, la structure se répète partout car elle est établie par les déplacements des moines au cours de la journée pour l’accomplissement de la règle.

Mais le cloître n’est pas un simple lieu de passage entre les édifices, où les galeries protègent les moines de l’intempérie. Selon les coutumiers, le cloître est aussi un espace pour méditer, lire et travailler.

Au milieu du XII^e siècle, les cloîtres furent rénovés pour leur accorder plus de somptuosité. Dans le cas de Sant Pere, la construction du nouveau cloître s’inscrivit dans une rénovation générale de l’ensemble. Il fut bâti sur le précédent, alors partiellement enterré, ce qui permit d’en agrandir la surface et de modifier la circulation entre les édifices.

Mais la différence principale réside dans l’incorporation de la décoration sculpturale suivant le style de l’époque, avec des colonnes doubles et des chapiteaux à figures. Malheureusement, la spoliation que subit le monastère entre les XIX^e et XX^e siècles a anéanti toute cette splendeur.

Au sud du cloître, il y a une salle avec des fenêtres en embrasure et plafond à voûte d’ogives. D’après le programme de construction des monastères bénédictins, cet espace correspondrait à la salle à manger communautaire. L’édifice a un niveau inférieur qui, en raison de ses conditions d’humidité et de température, était probablement utilisé comme entrepôt.

Pour les moines, les repas avaient un aspect rituel fixé par la règle qui décrit comment les faire. Les moines mangeaient en silence en écoutant la lecture que faisait l’un d’entre eux. La lecture et le service de la table étaient des tâches hebdomadaires que toute la communauté devait exercer par roulements.

La règle imposait également des préceptes concernant les repas, dont elle régulait les heures et les quantités, ainsi que les jeûnes et les abstinences, en considérant les besoins des malades, des vieillards et des enfants.

D’autres éléments présents dans le réfectoire sont la porte d’accès aux potagers, l’escalier menant au niveau inférieur et des canalisations faites dans la roche ; nous pouvons d’ailleurs voir dans le mur du réfectoire les restes de canalisations qui conduisaient les eaux de pluie.

Au Moyen Âge, la salle capitulaire du cloître était divisée en différentes salles dont il ne reste aucun élément d’origine nous permettant d’en interpréter l’usage. D’après le schéma des monastères bénédictins, il devait y avoir la salle capitulaire, la sacristie et l’espace destiné au rangement des livres et documents. Au-dessus devait se trouver le dortoir des moines, situé à côté de l’église afin de faciliter le déplacement à l’heure des prières nocturnes, notamment en hiver.

Dans les monastères, la porterie n’était pas un simple point d’accès. Elle marquait la frontière entre le monde extérieur et la clôture. À partir de là, seuls les moines pouvaient entrer dans l’enceinte.

Situé à côté du réfectoire et communiquant avec les potagers et la zones des étables, cette salle a été identifiée comme le garde-manger. À l’intérieur, il y avait une armoire à provisions et une citerne.

À l’intérieur de l’enceinte se trouve une place qui articule les accès à l’église et à l’espace de clôture. Elle fut réalisée dans le contexte d’une rénovation du XII^e siècle qui permit d’agrandir l’ensemble monastique. Pour bâtir la place, l’ancien cimetière fut recouvert en nivelant le terrain qui, jusqu’alors suivait la pente naturelle.

À la fin du Moyen Âge, dans un contexte de changements au sein de la vie communautaire, des habitations individuelles furent construites pour les moines dans la partie supérieure du cloître. Nous pouvons y voir des restes de fenêtres, balcons, cheminées et les anciens crépis des murs, correspondant à onze maisons du XVIII^e siècle.

Pour des besoins de défense, la tour fut bâtie aux XIII^e et XIV^e siècles sur une structure antérieure qui correspond avec la façade du X^e siècle. Les meurtrières sont les ouvertures d’origine, tandis que les fenêtres à arc en plein cintre et les portes d’accès depuis l’étage du cloître furent créées plus tard.

La tour se divise en plusieurs niveaux qui communiquent par des trappes. Dans la partie supérieure, une porte est conservée, par laquelle on accédait au balcon qui ressortait et était percé d’orifices pour se défendre quand l’attaque se produisait à la base de la tour. Il ne reste de ce balcon que les pierres autour de la tour sur lesquelles s’appuyait la plateforme.

La tour du clocher fut bâtie au XII^e siècle sur l’ancien édifice d’accès auquel correspondent les baies étroites de la base de la tour.

Il s’agit d’une structure à plan carré et trois niveaux. Aux deux premiers, les baies en plein cintre ne présentent pas d’éléments décoratifs mais au troisième, elles se caractérisent par des éléments de type lombard, comme les baies géminées à colonne, le couronnement d’arcs aveugles en dents de scie et trois oculi au couronnement de la tour.

Au XII^e siècle, un second déambulatoire – réservé aux membres de la communauté – fut bâti sur le déambulatoire auquel on accède de l’intérieur de l’église. Tout autour de ce second déambulatoire, plusieurs chapelles et deux arcosolia furent ouverts, dont des restes de peinture murale du XIII^e siècle sont conservés.

Un escalier en colimaçon, visible dans la chapelle de Sant Miquel, permettait d’accéder de l’église à ces chapelles du déambulatoire supérieur. Le culte de l’archange Michel donna lieu à un type de chapelles ou sanctuaires surélevés, comme dans ce cas.

La salle circulaire fut probablement utilisée comme sacristie. Bien qu’il n’y ait pas de preuves d’une chapelle dédiée à saint Martin, elle a reçu ce nom en raison d’une peinture murale représentant le saint offrant la moitié de sa cape à un pauvre.

La nef de la chapelle de Sant Miquel est couverte d’une voûte en berceau, tandis que la petite abside est couverte d’une voûte en quart de sphère où l’on peut voir une croix faite en pierre qui conserve encore les encoches pour y accrocher les lampes à huile.

Ressortant de l’ensemble du monastère dans la zone des jardins potagers se trouve un bâtiment rectangulaire à trois niveaux, qui se caractérise par ses arcades. Les documents indiquent que le rez-de-chaussée abritait au XVI^e siècle les étables. Les étages ne furent bâtis qu’au XVIII^e siècle, peut-être pour accueillir les familles qui étaient au service du monastère.

L’espace destiné à la culture des plantes potagères et médicinales se trouve au sud-est du monastère, pour profiter du soleil et des vents humides mais à l’abri de la tramontane.

À quelques mètres de l’entrée de l’enceinte monacale se trouvent les restes d’un édifice bâti aux XI^e et XII^e siècles qui faisait fonction d’hôtellerie. La règle bénédictine mettait l’accent sur la charité et l’hospitalité, ce qui se traduisit par la construction d’édifices extérieurs à la clôture afin que les monastères pussent accueillir les pauvres et les pèlerins sans que cela interférât sur la vie de la communauté.

Dans le cas de Sant Pere de Rodes, qui fut un centre de pèlerinage, l’arrivée massive se produisait lors de la célébration de l’Année Sainte chaque fois que le jour de la Sainte Croix tombait un vendredi, moment où les pèlerins pouvaient obtenir d’importantes indulgences.

Le service était administré par un moine, dénommé hospitalier, une fonction qui fut exercée à Sant Pere de Rodes au moins dès 1221, année de la première référence, jusqu’à l’abandon du monastère.

L’une des rénovations entreprises au XVIII^e siècle inclut la construction de la nouvelle sacristie, adossée à l’église, de plan rectangulaire et à trois niveaux.

Vu la détérioration qu’elle subit, il ne reste de l’original que la façade et elle fut aménagée en édifice de services.

L'abbé, la plus haute autorité du monastère, est le responsable de la vie spirituelle de la communauté, ainsi que des aspects temporels du monastère. Afin de garantir le bon fonctionnement de la communauté, la règle établit une série de fonctions auxquelles l’abbé accorde des responsabilités. Dans le compte rendu d’un chapitre de 1360, les fonctions suivantes apparaissent : le prieur, qui exerce aussi la fonction d’aumônier, le cellérier (intendant), le camérier (qui s’occupe du linge des moines), l’économe (qui perçoit les rentes), le sacristain (responsable du culte dans l’église et donc de tous les éléments matériels nécessaires), l'ouvrier (responsable des travaux), l'infirmier (responsable des malades), l'hôtelier (responsable des pèlerins), le pitancier (qui se charge des repas des moines les soirs d’étés) et les administrateurs (qui gèrent les possessions importantes).

À la première moitié du XV^e siècle, la construction d’un palais pour l’abbé est entreprise. D’après un inventaire de 1633, il était divisait en trois chambres, une étude, une écurie et un cellier mais il fut rénové au XVIII^e siècle pour faire une nouvelle division des espaces et remplacer les poutres par une voûte en berceau.

Très endommagé par l’abandon, les tâches de consolidation du palais eurent lieu plus tard qu’à d’autres endroits du monastère. À la fin des années soixante, seuls les murs extérieurs et quelques-uns de l’intérieur étaient conservés. L'action mise en œuvre dans les années quatre-vingt-dix l’adapta aux besoins d’un édifice de services. C’est pourquoi il ne reste du bâtiment d’origine que les murs extérieurs, couronnés de créneaux, et une fenêtre géminée de la façade principale.

Près du monastère se trouve la fontaine des Moines. Sur le bec, qui sort de la tête d’un animal fabuleux, nous pouvons lire une inscription datée de 1588: QUI BIBERIT EX AQUA SITIET ITERUM (Qui boira de cette eau, aura de nouveau soif), citant l'Évangile de saint Jean.