L’Arxiu Comarcal de l’Alt Empordà (ACAE) està integrat a la Xarxa d’Arxius Comarcals de la Generalitat de Catalunya, i la seva creació va ser acordada pel conveni signat el 31 de gener del 1984 entre el Departament de Cultura de la Generalitat de Catalunya i l’Ajuntament de Figueres, el qual col·labora a mantenir-lo. El Consell Comarcal de l’Alt Empordà en té delegada la gestió des de la seva creació.
La inauguració oficial va tenir lloc el dia 16 de febrer del 1991, amb l’assistència del president de la Generalitat. Està instal·lat a l’ala oest de l’antic escorxador municipal, edifici construït l’any 1907 per l’arquitecte modernista Josep Azemar.
L’ACAE té com a objectiu principal la conservació, la protecció i la difusió del patrimoni documental, tant públic com privat, de l’Alt Empordà.
